复旦大学新选课系统是为了适应随着教学改革而日益复杂的选课业务要求而开发，它于2005学年第二学期末正式投入使用，目前该系统面向全校本专科生，全方位支持每学期三轮选课中繁复的选课业务规则需求，提供年级专业保护、预选课随机筛选、抢课先到先得、期中退课申请等多种服务，并具备了良好的管理配置功能。随着系统更新和功能扩展，开课查询、查看大纲、课表浏览、退课保留人数、选课事务、免听申请等新功能也在不断地增加到系统中。2016年初选课系统全面升级，界面内容更丰富，选课过程更流畅，操作更人性化，提示更精确。系统可同时满足1万名学生在线。